Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms