Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms