Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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