Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Syde1Q9DBZ9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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