Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim23Q9DAL0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms