Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms