Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Erp27Q9D8U3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Erp27Q9D8U3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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