Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Echdc3Q9D7J9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms