Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms