Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms