Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PclafQ9CQX4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms