Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms