Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sf3b1Q99NB9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms