Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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