Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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