Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Vmn1r200Q8R281 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Vmn1r200Q8R281 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Vmn1r200Q8R281 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Vmn1r200Q8R281 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Vmn1r200Q8R281 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Vmn1r200Q8R281 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Vmn1r200Q8R281 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Vmn1r200Q8R281 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r200Q8R281 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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