Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms