Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm9955Q8CEJ8 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms