Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Nhlrc3Q8CCH2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Nhlrc3Q8CCH2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Nhlrc3Q8CCH2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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