Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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