Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms