Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim6Q8BGE7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim6Q8BGE7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim6Q8BGE7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim6Q8BGE7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim6Q8BGE7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim6Q8BGE7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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