Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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