Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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