Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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