Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms