Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nphp3Q7TNH6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms