Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Scn4bQ7M729 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Scn4bQ7M729 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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