Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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