Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms