Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms