Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms