Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms