Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Q6DFW0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q6DFW0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms