Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PtprdQ64487 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PtprdQ64487 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PtprdQ64487 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprdQ64487 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprdQ64487 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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