Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim25Q61510 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Trim25Q61510 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim25Q61510 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim25Q61510 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim25Q61510 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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