Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ecm1Q61508 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ecm1Q61508 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ecm1Q61508 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ecm1Q61508 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ecm1Q61508 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms