Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ncor1Q60974 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ncor1Q60974 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ncor1Q60974 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ncor1Q60974 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ncor1Q60974 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ncor1Q60974 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ncor1Q60974 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ncor1Q60974 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ncor1Q60974 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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