Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stxbp3Q60770 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stxbp3Q60770 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms