Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms