Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms