Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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