Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms