Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Lrrc43Q3V0L5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Lrrc43Q3V0L5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Lrrc43Q3V0L5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Lrrc43Q3V0L5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Lrrc43Q3V0L5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Lrrc43Q3V0L5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Lrrc43Q3V0L5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms