Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms