Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3UPC7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3UPC7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms