Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms