Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc28Q3TX51 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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