Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms