Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms